En el Hipódromo, entonces estadio del Madrid, nació la idea de fundar un club vasco de fútbol, después de haber derrotado a los catalanes. Ya bajo esta denominación, el equipo consiguió su primer ascenso a la Segunda División «B» en la temporada 1992-93 y se mantuvo en ella durante 4 años, hasta que el descenso a dicha categoría del primer equipo filial les relegó a regresar a la Tercera División, en donde se han mantenido desde entonces.